Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms