Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN7P35236 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms