Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPC1P35052 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPC1P35052 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms