Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ARID4AP29374 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARID4AP29374 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms