Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5A1P25705 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms