Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHP20396 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHP20396 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHP20396 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHP20396 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms