Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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