Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSPP15924 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSPP15924 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSPP15924 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms