Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms