Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHGAP10645 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHGAP10645 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHGAP10645 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms