Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR2F1P10589 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR2F1P10589 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms