Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4BP0C0L5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4BP0C0L5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4BP0C0L5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C4BP0C0L5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C4BP0C0L5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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