Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOGA1O94964 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms