Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCEO43556 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCEO43556 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCEO43556 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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