Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms