Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2K7ER74 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms