Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB9F8W1W9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB9F8W1W9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms