Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPIPA5E9PKD4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPIPA5E9PKD4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms