Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SMIM1B2RUZ4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms