Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms