Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms