Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms