Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERGIC3Q9Y282 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms