Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SETD1BQ9UPS6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms