Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCF2Q9UG63 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms