Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms