Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms