Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABI3Q9P2A4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms