Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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