Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCHIP1Q9P0W5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms