Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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