Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM6Q9NX76 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms