Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms