Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCIQ9NVI1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms