Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ARFGAP3Q9NP61 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms