Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CADM1Q9BY67 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CADM1Q9BY67 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms