Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPOQ9BU64 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms