Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM208Q9BTX3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM208Q9BTX3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms