Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PMCHL2Q9BQD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PMCHL2Q9BQD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms