Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRBNQ96SW2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms