Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP4Q96P64 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms