Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms