Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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EP400Q96L91 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EP400Q96L91 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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