Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED12Q93074 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED12Q93074 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED12Q93074 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED12Q93074 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms