Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOPBP1Q92547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms