Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms