Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEDD1Q8NHV4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms