Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDDC3Q8N4P3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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