Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP4Q8N2S1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms