Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms